M Buna Nom indigène pour nommer les poissons de lac Malawi qui broutent les algues poussant sur les rochers. Les Melanochromis, Labidochromis, Pseudotropheus et Labeotropheus font, entre autres, partie du groupe des m'bunas.
Madrépore : animal marin du groupe des coraux doté d’un squelette externe. Les madrépores jouent un grand rôle dans l’édification des récifs coralliens.
Mangrove : forêt littorale tropicale caractérisée par la présence de palétuviers, arbres dont les racines, en forme d’échasses, s’enfoncent dans la vase des estuaires et des lagunes saumâtres.
Marcottage Technique consistant à prendre une branche encore reliée au pied mère et de la mettre dans le sol afin de l'enraciner. Une fois enraciné, on peut la séparer du pied mère.
Masse filtrante Matériau poreux servant de support aux bactéries dénitrifiantes et laissant passer l'eau en retenant les déchets organiques.
Mélanine Pigment qui se trouve dans les mélanophores et chromatophores de l'épiderme du poisson et qui permettent à ce dernier de prendre des couleurs allant du brun au noir.
Métabolisme Transformation par un être vivant des différents éléments qui le composent.
Microphage Organisme qui se nourrit de proies microscopiques ou tout au moins très petites.
Microsporidie : protozoaire ne possédant pas d’organe locomoteur, capable de former des spores.
Milieu acide : il a un pH inférieur à 7 ce qui est souvent dû à de la végétation en décomposition ou à une filtration sur tourbe. Opposé à basique.
Minéralité Quantité de sels minéraux dissout dans l'eau.
Morphologie Aspect, forme et structure des êtres vivants.
Mucus fluide gluant produit par les animaux pour lubrifier ou protéger les surfaces délicates de l’organisme. Chez les poissons, les écailles sont recouvertes de mucus, ce qui facilite les mouvements dans l’eau et limite la pénétration de micro-organismes, susceptibles de causer des maladies.
Muer Perdre sa peau (dans le cas des reptiles) ou sa carapace pour les crustacés lorsque celle ci est trop petite. Une nouvelle peau (ou carapace) repousse alors.
Muil Humus doux, léger, poussiéreux, brun, résultant en majorité de la dégradation des végétaux morts.
Mutation Modification: du patrimoine génétique ; apparition dans une lignée, de caractères nouveaux par suite d'un changement de structure des chromosomes. Il est quelquefois possible de la maintenir en la fixant sur plusieurs générations.
Mutualisme Association interactive de deux organismes présentant un bénéfice réciproque pour les deux espèces (source IFREMER).
Mysis Petites crevettes.
Myxobacteries Bactéries pathogènes reconnaissables au microscope grâce à leur forme filamenteuse.